Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
S1PR1P21453 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
S1PR1P21453 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
S1PR1P21453 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms