Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
TCN1P20061 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN1P20061 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN1P20061 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN1P20061 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCN1P20061 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN1P20061 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN1P20061 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCN1P20061 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN1P20061 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCN1P20061 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN1P20061 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN1P20061 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN1P20061 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN1P20061 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCN1P20061 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN1P20061 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN1P20061 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCN1P20061 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN1P20061 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCN1P20061 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCN1P20061 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCN1P20061 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCN1P20061 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN1P20061 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN1P20061 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN1P20061 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN1P20061 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCN1P20061 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN1P20061 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN1P20061 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN1P20061 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN1P20061 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN1P20061 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCN1P20061 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN1P20061 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN1P20061 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN1P20061 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TCN1P20061 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN1P20061 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN1P20061 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN1P20061 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCN1P20061 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN1P20061 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCN1P20061 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCN1P20061 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCN1P20061 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCN1P20061 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN1P20061 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN1P20061 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN1P20061 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCN1P20061 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN1P20061 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN1P20061 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN1P20061 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCN1P20061 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCN1P20061 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TCN1P20061 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN1P20061 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN1P20061 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN1P20061 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN1P20061 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCN1P20061 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN1P20061 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN1P20061 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN1P20061 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN1P20061 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCN1P20061 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN1P20061 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCN1P20061 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCN1P20061 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCN1P20061 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCN1P20061 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms