Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITGB6P18564 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB6P18564 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB6P18564 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB6P18564 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB6P18564 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms