Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF43P17038 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF43P17038 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF43P17038 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms