Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD44P16070 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CD44P16070 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD44P16070 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD44P16070 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CD44P16070 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD44P16070 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD44P16070 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CD44P16070 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD44P16070 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD44P16070 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD44P16070 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD44P16070 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CD44P16070 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD44P16070 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD44P16070 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD44P16070 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD44P16070 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD44P16070 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD44P16070 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD44P16070 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD44P16070 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD44P16070 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD44P16070 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD44P16070 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CD44P16070 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CD44P16070 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CD44P16070 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CD44P16070 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD44P16070 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD44P16070 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD44P16070 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CD44P16070 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CD44P16070 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CD44P16070 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CD44P16070 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CD44P16070 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD44P16070 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD44P16070 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD44P16070 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD44P16070 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CD44P16070 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD44P16070 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD44P16070 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD44P16070 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD44P16070 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CD44P16070 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CD44P16070 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD44P16070 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD44P16070 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD44P16070 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD44P16070 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD44P16070 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD44P16070 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD44P16070 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD44P16070 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD44P16070 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD44P16070 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD44P16070 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD44P16070 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD44P16070 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD44P16070 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD44P16070 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD44P16070 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD44P16070 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD44P16070 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CD44P16070 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD44P16070 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD44P16070 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD44P16070 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD44P16070 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD44P16070 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD44P16070 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD44P16070 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD44P16070 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD44P16070 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CD44P16070 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD44P16070 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD44P16070 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD44P16070 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD44P16070 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms