Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNRPBP14678 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNRPBP14678 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPBP14678 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNRPBP14678 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms