Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RARGP13631 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RARGP13631 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARGP13631 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RARGP13631 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARGP13631 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RARGP13631 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARGP13631 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RARGP13631 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RARGP13631 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARGP13631 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARGP13631 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RARGP13631 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARGP13631 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RARGP13631 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARGP13631 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARGP13631 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARGP13631 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARGP13631 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RARGP13631 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARGP13631 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RARGP13631 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RARGP13631 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARGP13631 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARGP13631 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARGP13631 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARGP13631 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RARGP13631 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARGP13631 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RARGP13631 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RARGP13631 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RARGP13631 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RARGP13631 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARGP13631 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RARGP13631 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RARGP13631 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RARGP13631 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARGP13631 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARGP13631 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARGP13631 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RARGP13631 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RARGP13631 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARGP13631 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARGP13631 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RARGP13631 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms