Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD8BP10966 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD8BP10966 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD8BP10966 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8BP10966 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8BP10966 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD8BP10966 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8BP10966 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8BP10966 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8BP10966 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD8BP10966 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD8BP10966 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8BP10966 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8BP10966 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8BP10966 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD8BP10966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD8BP10966 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD8BP10966 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8BP10966 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD8BP10966 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD8BP10966 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD8BP10966 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD8BP10966 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8BP10966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8BP10966 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8BP10966 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD8BP10966 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8BP10966 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8BP10966 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8BP10966 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD8BP10966 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8BP10966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8BP10966 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD8BP10966 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8BP10966 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8BP10966 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8BP10966 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD8BP10966 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms