Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPP1P10451 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPP1P10451 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPP1P10451 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPP1P10451 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPP1P10451 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPP1P10451 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPP1P10451 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPP1P10451 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPP1P10451 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPP1P10451 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPP1P10451 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPP1P10451 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPP1P10451 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPP1P10451 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPP1P10451 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPP1P10451 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPP1P10451 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPP1P10451 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPP1P10451 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPP1P10451 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPP1P10451 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPP1P10451 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPP1P10451 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPP1P10451 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPP1P10451 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPP1P10451 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPP1P10451 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPP1P10451 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPP1P10451 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPP1P10451 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPP1P10451 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPP1P10451 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPP1P10451 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPP1P10451 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPP1P10451 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPP1P10451 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPP1P10451 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPP1P10451 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPP1P10451 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPP1P10451 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPP1P10451 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPP1P10451 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPP1P10451 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPP1P10451 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPP1P10451 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPP1P10451 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPP1P10451 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPP1P10451 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPP1P10451 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPP1P10451 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPP1P10451 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms