Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC192P0DO97 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC192P0DO97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC192P0DO97 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC192P0DO97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms