Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CFC1P0CG37 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFC1P0CG37 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFC1P0CG37 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms