Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
HOXB7P09629 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
HOXB7P09629 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HOXB7P09629 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HOXB7P09629 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
HOXB7P09629 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXB7P09629 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms