Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL1A2P08123 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL1A2P08123 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL1A2P08123 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL1A2P08123 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL1A2P08123 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL1A2P08123 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL1A2P08123 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL1A2P08123 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL1A2P08123 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COL1A2P08123 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL1A2P08123 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL1A2P08123 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL1A2P08123 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL1A2P08123 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL1A2P08123 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COL1A2P08123 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL1A2P08123 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COL1A2P08123 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL1A2P08123 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL1A2P08123 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL1A2P08123 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL1A2P08123 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL1A2P08123 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
COL1A2P08123 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL1A2P08123 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms