Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRM2P04554 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRM2P04554 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRM2P04554 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRM2P04554 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRM2P04554 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRM2P04554 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRM2P04554 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRM2P04554 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRM2P04554 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRM2P04554 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRM2P04554 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRM2P04554 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRM2P04554 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRM2P04554 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRM2P04554 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRM2P04554 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRM2P04554 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PRM2P04554 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRM2P04554 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRM2P04554 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRM2P04554 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRM2P04554 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRM2P04554 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRM2P04554 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRM2P04554 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRM2P04554 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRM2P04554 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRM2P04554 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRM2P04554 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRM2P04554 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRM2P04554 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRM2P04554 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRM2P04554 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRM2P04554 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRM2P04554 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRM2P04554 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRM2P04554 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRM2P04554 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRM2P04554 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRM2P04554 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRM2P04554 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms