Protein–RNA interactions for Protein: P04040

CAT, Catalase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATP04040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATP04040 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATP04040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CATP04040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATP04040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CATP04040 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CATP04040 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CATP04040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATP04040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATP04040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CATP04040 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATP04040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CATP04040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CATP04040 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATP04040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATP04040 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATP04040 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CATP04040 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CATP04040 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CATP04040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CATP04040 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CATP04040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CATP04040 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CATP04040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CATP04040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATP04040 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATP04040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CATP04040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATP04040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CATP04040 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATP04040 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATP04040 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATP04040 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CATP04040 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CATP04040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATP04040 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATP04040 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATP04040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CATP04040 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CATP04040 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms