Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOA1P02647 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOA1P02647 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA1P02647 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA1P02647 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA1P02647 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA1P02647 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOA1P02647 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA1P02647 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOA1P02647 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA1P02647 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA1P02647 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA1P02647 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOA1P02647 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA1P02647 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA1P02647 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA1P02647 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOA1P02647 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
APOA1P02647 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA1P02647 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA1P02647 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APOA1P02647 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA1P02647 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA1P02647 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA1P02647 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA1P02647 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA1P02647 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA1P02647 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA1P02647 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA1P02647 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA1P02647 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA1P02647 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA1P02647 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA1P02647 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA1P02647 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA1P02647 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA1P02647 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA1P02647 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA1P02647 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA1P02647 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA1P02647 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOA1P02647 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA1P02647 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA1P02647 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA1P02647 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA1P02647 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA1P02647 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms