Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CPNE6O95741 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE6O95741 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE6O95741 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE6O95741 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms