Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAPBO95292 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAPBO95292 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAPBO95292 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAPBO95292 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAPBO95292 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAPBO95292 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAPBO95292 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAPBO95292 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAPBO95292 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAPBO95292 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAPBO95292 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAPBO95292 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAPBO95292 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAPBO95292 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAPBO95292 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAPBO95292 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAPBO95292 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAPBO95292 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAPBO95292 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAPBO95292 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAPBO95292 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAPBO95292 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAPBO95292 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAPBO95292 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAPBO95292 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAPBO95292 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAPBO95292 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAPBO95292 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VAPBO95292 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VAPBO95292 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAPBO95292 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VAPBO95292 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAPBO95292 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
VAPBO95292 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VAPBO95292 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAPBO95292 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAPBO95292 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAPBO95292 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VAPBO95292 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAPBO95292 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAPBO95292 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAPBO95292 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VAPBO95292 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VAPBO95292 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VAPBO95292 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VAPBO95292 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAPBO95292 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAPBO95292 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VAPBO95292 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VAPBO95292 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAPBO95292 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VAPBO95292 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms