Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG12O94817 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG12O94817 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG12O94817 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG12O94817 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATG12O94817 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG12O94817 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG12O94817 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG12O94817 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG12O94817 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG12O94817 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG12O94817 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG12O94817 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG12O94817 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG12O94817 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG12O94817 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG12O94817 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG12O94817 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG12O94817 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG12O94817 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG12O94817 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG12O94817 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG12O94817 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG12O94817 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG12O94817 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG12O94817 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG12O94817 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG12O94817 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG12O94817 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG12O94817 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG12O94817 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG12O94817 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATG12O94817 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ATG12O94817 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG12O94817 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG12O94817 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG12O94817 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG12O94817 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG12O94817 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG12O94817 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG12O94817 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG12O94817 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG12O94817 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG12O94817 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.5 ms