Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALDH1A2O94788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALDH1A2O94788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ALDH1A2O94788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALDH1A2O94788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALDH1A2O94788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms