Protein–RNA interactions for Protein: O76050

NEURL1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1O76050 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1O76050 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1O76050 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEURL1O76050 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEURL1O76050 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEURL1O76050 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEURL1O76050 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms