Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC19A2O60779 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC19A2O60779 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC19A2O60779 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC19A2O60779 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms