Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GFRA3O60609 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GFRA3O60609 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA3O60609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA3O60609 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GFRA3O60609 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GFRA3O60609 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA3O60609 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms