Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF3IP2O43734 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAF3IP2O43734 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAF3IP2O43734 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAF3IP2O43734 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms