Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BUD23O43709 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BUD23O43709 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BUD23O43709 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BUD23O43709 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BUD23O43709 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BUD23O43709 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BUD23O43709 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BUD23O43709 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BUD23O43709 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BUD23O43709 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BUD23O43709 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BUD23O43709 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BUD23O43709 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BUD23O43709 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BUD23O43709 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BUD23O43709 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BUD23O43709 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BUD23O43709 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BUD23O43709 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BUD23O43709 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BUD23O43709 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BUD23O43709 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BUD23O43709 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BUD23O43709 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BUD23O43709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BUD23O43709 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BUD23O43709 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BUD23O43709 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BUD23O43709 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BUD23O43709 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BUD23O43709 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BUD23O43709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BUD23O43709 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BUD23O43709 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BUD23O43709 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BUD23O43709 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BUD23O43709 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BUD23O43709 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BUD23O43709 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BUD23O43709 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BUD23O43709 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BUD23O43709 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BUD23O43709 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BUD23O43709 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BUD23O43709 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BUD23O43709 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms