Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF208O43345 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF208O43345 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF208O43345 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF208O43345 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms