Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MAP3K13O43283 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K13O43283 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MAP3K13O43283 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms