Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PJA2O43164 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PJA2O43164 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PJA2O43164 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA2O43164 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA2O43164 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PJA2O43164 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PJA2O43164 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA2O43164 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA2O43164 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA2O43164 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PJA2O43164 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PJA2O43164 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PJA2O43164 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PJA2O43164 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PJA2O43164 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA2O43164 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA2O43164 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA2O43164 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PJA2O43164 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PJA2O43164 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PJA2O43164 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PJA2O43164 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PJA2O43164 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA2O43164 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA2O43164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PJA2O43164 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA2O43164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA2O43164 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA2O43164 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA2O43164 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PJA2O43164 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA2O43164 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA2O43164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA2O43164 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA2O43164 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PJA2O43164 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PJA2O43164 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PJA2O43164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA2O43164 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA2O43164 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA2O43164 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA2O43164 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA2O43164 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA2O43164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA2O43164 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA2O43164 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA2O43164 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA2O43164 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PJA2O43164 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PJA2O43164 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PJA2O43164 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PJA2O43164 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA2O43164 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA2O43164 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA2O43164 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PJA2O43164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PJA2O43164 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PJA2O43164 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PJA2O43164 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PJA2O43164 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms