Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EPHB6O15197 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB6O15197 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB6O15197 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EPHB6O15197 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB6O15197 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms