Protein–RNA interactions for Protein: O15085

ARHGEF11, Rho guanine nucleotide exchange factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF11O15085 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
ARHGEF11O15085 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
ARHGEF11O15085 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ARHGEF11O15085 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
ARHGEF11O15085 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
ARHGEF11O15085 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
ARHGEF11O15085 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
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