Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPTBN2O15020 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SPTBN2O15020 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPTBN2O15020 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SPTBN2O15020 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN2O15020 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN2O15020 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPTBN2O15020 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPTBN2O15020 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms