Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
O00370 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
O00370 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
O00370 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
O00370 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
O00370 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
O00370 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
O00370 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
O00370 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
O00370 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
O00370 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
O00370 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
O00370 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
O00370 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
O00370 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
O00370 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
O00370 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
O00370 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
O00370 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
O00370 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
O00370 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
O00370 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
O00370 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
O00370 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
O00370 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
O00370 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
O00370 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
O00370 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
O00370 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
O00370 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
O00370 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
O00370 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
O00370 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
O00370 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
O00370 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
O00370 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
O00370 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
O00370 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
O00370 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
O00370 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms