Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF11BO00300 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFRSF11BO00300 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFRSF11BO00300 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFRSF11BO00300 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms