Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
J3QKU1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
J3QKU1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
J3QKU1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QKU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QKU1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QKU1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
J3QKU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QKU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QKU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QKU1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QKU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
J3QKU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QKU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QKU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QKU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
J3QKU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
J3QKU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QKU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QKU1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QKU1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
J3QKU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
J3QKU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
J3QKU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QKU1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QKU1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QKU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
J3QKU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QKU1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QKU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
J3QKU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QKU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QKU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
J3QKU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QKU1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QKU1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QKU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QKU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
J3QKU1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QKU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QKU1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QKU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
J3QKU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QKU1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QKU1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QKU1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
J3QKU1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QKU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QKU1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QKU1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
J3QKU1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QKU1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QKU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
J3QKU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
J3QKU1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QKU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QKU1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QKU1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
J3QKU1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QKU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
J3QKU1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
J3QKU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms