Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3BMQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3BMQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3BMQ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3BMQ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3BMQ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BMQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BMQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BMQ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3BMQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BMQ9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BMQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BMQ9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3BMQ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3BMQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BMQ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3BMQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BMQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H3BMQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H3BMQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BMQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BMQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BMQ9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H3BMQ9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BMQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BMQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BMQ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H3BMQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BMQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BMQ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BMQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BMQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BMQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BMQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BMQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BMQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BMQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BMQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BMQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BMQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BMQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BMQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BMQ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms