Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
B4DXG7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
B4DXG7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DXG7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DXG7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DXG7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DXG7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
B4DXG7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
B4DXG7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DXG7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DXG7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DXG7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
B4DXG7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DXG7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DXG7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
B4DXG7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DXG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DXG7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DXG7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DXG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
B4DXG7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
B4DXG7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
B4DXG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4DXG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4DXG7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4DXG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
B4DXG7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
B4DXG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
B4DXG7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4DXG7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4DXG7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4DXG7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4DXG7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
B4DXG7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B4DXG7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B4DXG7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
B4DXG7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B4DXG7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
B4DXG7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
B4DXG7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B4DXG7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
B4DXG7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
B4DXG7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
B4DXG7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
B4DXG7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
B4DXG7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
B4DXG7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
B4DXG7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B4DXG7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms