Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF879B4DU55 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF879B4DU55 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF879B4DU55 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF879B4DU55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms