Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF99A8MXY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF99A8MXY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF99A8MXY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF99A8MXY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms