Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SDR42E2A6NKP2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDR42E2A6NKP2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SDR42E2A6NKP2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SDR42E2A6NKP2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SDR42E2A6NKP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms