Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL1A6NKG5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL1A6NKG5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RTL1A6NKG5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTL1A6NKG5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RTL1A6NKG5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RTL1A6NKG5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms