Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C5orf51A6NDU8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C5orf51A6NDU8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf51A6NDU8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms