Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCRBV7S3A2A0A539 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCRBV7S3A2A0A539 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV7S3A2A0A539 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV7S3A2A0A539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV7S3A2A0A539 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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