Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0U1RRA0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0U1RRA0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms