Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
USP20Q9Y2K6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms