Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALD1Q9ULE6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALD1Q9ULE6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms