Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RDH8Q9NYR8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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