Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SNTG1Q9NSN8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms