Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms