Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms