Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP43Q70EL4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms